Bureau d'études environnementales

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L’ADN : un outil puissant pour la conservation de la biodiversité

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L’ADN, support de l’information génétique, renferme une mine de données essentielles pour comprendre et préserver les espèces. Le rôle du généticien de la conservation ? Décrypter ce code complexe pour en extraire des informations exploitables, que ce soit à l’échelle des gènes (génétique) ou, grâce aux progrès technologiques récents, à celle du génome entier (génomique).

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Une révolution technologique au service de la biodiversité

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Le séquençage de l’ADN, possible depuis les années 1970, a connu une accélération spectaculaire avec l’avènement des méthodes de séquençage nouvelle génération (NGS) à partir de 2005. Pour illustration : le premier génome humain, séquencé en 2003, avait nécessité 13 ans de travail et 3 milliards de dollars. En 2009, ce coût était tombé à 20 000 dollars. En 2015, un génome humain pouvait être séquencé en quelques jours pour 1 000 dollars.

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Cette démocratisation a permis d’étudier des espèces non modèles – bien loin de l’humain ou de la drosophile –, ouvrant la voie à la génétique de la conservation et à la génétique du paysage. Ces disciplines fournissent aujourd’hui des bases scientifiques solides pour éclairer les décisions de gestion et renforcer l’impact des projets de conservation auprès des décideurs.

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Une expertise accessible aux acteurs de terrain

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Autrefois réservées aux laboratoires de recherche en raison de leur haute technicité, ces compétences sont désormais mobilisables par des bureaux d’études spécialisés comme BiodivConnect, en partenariat avec des chercheurs et des plateformes de biologie moléculaire.

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Pourquoi la connectivité écologique est-elle essentielle ?

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Maintenir ou restaurer la connectivité écologique est indispensable pour enrayer le déclin de la biodiversité. Un réseau écologique fonctionnel permet aux espèces d’assurer des processus vitaux :

• Adaptation aux changements climatiques (recherche de milieux favorables)
• Recherche quotidienne de nourriture
• Migration et reproduction
• Maintien de la diversité génétique

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Des méthodes toujours plus précises

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Les approches d’étude de la connectivité évoluent rapidement, intégrant un réalisme biologique et paysager croissant dans les modèles. Deux grandes familles de méthodes se distinguent :

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Méthodes population-centrées

Basée sur les caractéristiques du paysage, elle quantifie les liens entre habitats à l’aide de la théorie des graphes (programme GRAPHAB, Foltête et al., 2012). Cette approche, utilisée en médecine, transports ou neurosciences, permet en écologie de modéliser des réseaux de taches d’habitat et d’identifier les corridors ou barrières pour les espèces.

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Méthodes individu-centrées

Elle considère le paysage du point de vue des espèces, en analysant leur utilisation réelle des milieux pour accomplir leur cycle de vie. Des outils comme SIMOÏKO (développé par Terroïko, www.terroiko.fr) évaluent non seulement les flux entre habitats, mais aussi la taille et la stabilité des populations.

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Une démarche à la fois utile et réglementaire

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L’étude de la connectivité s’impose dans de nombreux projets d’aménagement, qu’ils soient urbains, ruraux ou infrastructurels. Elle concerne ainsi :

• L’évaluation des politiques publiques d’aménagement
• La planification urbaine et industrielle
• La gestion des espaces naturels
• Les infrastructures de transport et d’énergie

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Transformer les données en cartes d’habitats favorables

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Grâce à la compilation de données naturalistes (présences, absences ou pseudo-absences) et à leur croisement avec des variables environnementales (climat, habitats, caractéristiques physiques, interactions entre espèces…), les modèles de distribution d’espèces permettent de cartographier les zones potentiellement favorables à une espèce donnée. Ces approches, nourries par des bases de données toujours plus riches, offrent une vision spatialisée et dynamique des habitats propices à la biodiversité.

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Des applications concrètes pour la gestion et la planification

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Ces modèles trouvent des usages variés et opérationnels :

• Cartographier les réservoirs de biodiversité (trames écologiques, atlas communaux)
• Optimiser les protocoles d’échantillonnage ou cibler la recherche de nouvelles espèces
• Délimiter des aires protégées adaptées aux espèces menacées
• Guider les projets de réintroduction ou de translocation

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Anticiper les changements pour agir aujourd’hui

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Le principal atout de ces méthodes réside dans leur caractère prédictif :

• Reconstituer l’évolution passée des habitats (notamment sous l’effet du climat)
• Simuler l’impact futur des activités humaines ou des changements climatiques
• Éclairer les décisions pour préserver ou restaurer des milieux essentiels à la survie des espèces

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